Vespertilio di taglia media. Lunghezza dell'avambraccio 39-45 mm, peso 7-12 g. Il Myotis bechsteinii può essere agevolmente distinto dalle specie congeneriche per le notevoli dimensioni delle orecchie, che distese in avanti oltrepassano in modo evidente la punta del muso. Il bordo esterno del padiglione auricolare è solcato da 9 pieghe trasversali. Il trago, di forma marcatamente lanceolata, ha lunghezza prossima alla metà dell'orecchio. I piedi sono piccoli. Lo sperone è diritto e prende da un terzo a metà del bordo dell'uropatagio. La pelliccia è formata da peli lunghi, di colore grigio scuro nella porzione basale e presenta una notevole demarcazione cromatica tra addome chiaro e dorso marrone, ben evidente negli individui appesi. I giovani hanno un tono generale più grigio. I sessi sono simili, facilmente riconoscibili attraverso l'osservazione dei caratteri sessuali secondari.