Tutti i Crocidurini si distinguono dagli altri Insettivori per la totale mancanza di pigmentazione rossa sulle cuspidi dentali. La taglia è generalmente maggiore rispetto ai Soricini, inoltre dal mantello del corpo e della coda emergono alcuni peli più lunghi. La Crocidura minore presenta sul dorso una colorazione bruno-rossastra, talora tendente al marrone con riflessi argentei, che gradualmente si schiarisce verso il ventre il quale si colora di un grigio-giallastro. Manca una netta linea di demarcazione dorsoventrale, carattere che permette di distinguerla dalla congenerica Crocidura ventre bianco. La colorazione delle zampe tende al bruno chiaro con toni rossicci. La coda, di modesta lunghezza (28-44 mm), presenta una colorazione bruno-giallastra con uno scarso contrasto cromatico tra la parte superiore e quella inferiore. La specie presenta inoltre una forte variabilità genetica.